Компания Sequoia genetics, входящая в Группу компаний Алкор Био, начала реализацию первого комплексного проекта по созданию информационной среды для анализа персональных геномов в медицинских целях.
В реализации проекта, получившего название «Персонализированная геномная диагностика», помимо Sequoia genetics также примут участие американская корпорация EMC и специалисты в области биоинформатики из нескольких петербургских университетов. Данный проект имеет мировую новизну, площадкой для его реализации станет инновационный центр «Сколково».
Говоря о сути и значимости проекта, стоит отметить, что компания Sequoia genetics выступила инициатором начала масштабной работы по консолидированию ресурсов и знаний в области секвенирования ДНК, генетики человека, алгоритмической биологии и информационных технологий с целью создания уникального продукта, предназначенного для решения задач персонализированной медицины. Проект «Персонализированная геномная диагностика» направлен на создание интерактивного инструмента для врачей-генетиков, с помощью которого станет возможным проводить весь спектр необходимых генетических исследований индивидуальных геномов пациентов, основываясь на данных полногеномного секвенирования.
Медико-генетическое направление и координацию работ по проекту взяла на себя компания Sequoia genetics, создание решений для работы с большими объемами данных (BIG DATA) и виртуализацию осуществит корпорация EMC, разработка алгоритмов анализа данных будет проведена командой ученых-биоинформатиков из нескольких петербургских университетов.
«Сегодня в мире происходит бурное накопление знаний в области молекулярно-генетической диагностики, — рассказывает руководитель проекта Александр Павлов. — Новые данные о геноме, мутациях и ассоциированных с ними заболеваниях появляются столь стремительно, что производители реагентов для молекулярно-генетической диагностики, вероятнее всего, довольно скоро перестанут успевать разрабатывать тест-системы с учетом все возрастающего потока информации. В Группе компаний Алкор Био мы попытались отчасти решить эту проблему посредством разработки тест-систем на основе биочипов, позволяющих проанализировать сразу несколько десятков и даже сотен мутаций. По нашему мнению, проект «Персонализированная геномная диагностика» — это следующий шаг в данном направлении, его реализация позволит вывести современную молекулярно-генетическую диагностику на качественно новый уровень».
Основная идея проекта заключается в создании универсальной и масштабируемой IT архитектуры, которая включает ряд специализированных решений для:
Создание подобного унифицированного решения в области здравоохранения, пока не имеющего мирового аналога, является сложной задачей, требующей привлечения специалистов из разных областей — клинических генетиков, молекулярных биологов, биоинформатиков, инженеров в области IT и многих других.
Компания Sequoia genetics, входящая в состав Группы компаний Алкор Био, создана специально для работы над проектом «Персонализированная геномная диагностика», который является следующим этапом в развитии направления молекулярно-генетическая диагностика.
История Группы компаний Алкор Био началась в 1992 году. В настоящий момент ГК Алкор Био является крупнейшим на Северо-Западе России биотехнологическим холдингом, объединяющим 10 компаний и являющимся лидером среди отечественных производителей реагентов для иммуноферментного анализа. Основные направления деятельности Группы компаний: разработка, производство и реализация наборов для иммуноферментного и молекулярно-генетического анализа; разработка новых клеточных технологий и дальнейшее их внедрение в клиническую практику; банкирование гемопоэтических стволовых клеток пуповинной крови; проведение лабораторных исследований для населения; инвестиции в высокотехнологичные проекты в области биотехнологий.
Корпорация EMC (NYSE: EMC) является ведущим мировым разработчиком и поставщиком технологий для организации информационной инфраструктуры. Предлагаемые корпорацией решения позволяют организациям любых размеров полностью изменить подход к организации своей структуры, методам конкуренции, а также использовать информацию для получения прибыли. 8 февраля 2012 года корпорация EMC и Фонд развития и коммерциализации новых технологий «Сколково» подписали соглашение о создании нового центра исследований и разработок EMC, который займется созданием решений для облачных вычислений и аналитики BIG DATA в области биоинформатики и энергоэффективности. В ближайшие три года корпорацией планируется привлечь для работы в новом центре до 50 специалистов, в том числе из сотрудников своего российского представительства. В настоящее время у EMC уже имеется крупный центр разработок в Санкт-Петербурге, где работает порядка 300 человек. Исследовательский центр в «Сколково» станет единственным для корпорации по направлениям биоинформатики и энергоэффективности. Он будет расположен непосредственно в «наукограде», но тесно связан с научно-исследовательским центром EMC в Санкт-Петербурге для оптимального взаимодействия.
Анна Соснора